To katolske misjonærer står ovenfor den store prøven på sin tro når de reiser til Japan på leting etter deres savnede mentor. Dette i en tid da kristendom var bannlyst og deres tilstedeværelse var høyst uønsket. Kristne som ble tatt sto overfor det endelige valget: oppgi Kristus ved å spotte ham eller en skjebne fylt av frykt, tortur og en uunngåelig smertefull død.