Scooby-Doo! and the Samurai Sword

På Tokyos museum for antikk historie blir Mr Takagawa og Kenji vitne til oppstandelsen av The Black Samurai, en eldgammel kriger. Hans rustning var også den nyeste utstillingen på museet. Neste dag ankommer gjengen til Tokyo der Daphne skal delta i en kampsportturnering på en skole. En natt, under en fest, dukker The Black Samurai opp med sin Ninjakrigere og angriper skolen og stjeler rullen...