Når alt annet slår feil - slår de til! De kalles G.I. Joe og er en topphemmelig innsatsstyrke som består av verdens beste elitesoldater. Etter at et høyteknologisk, hemmelig våpen blir stjålet av den mystiske og hensynsløse Cobra-organisasjonen, må G.I. Joe-gruppen kjempe mot klokken for å forhindre at Cobra bruker våpenet som kan føre verden ut i et totalt kaos.