Mies, nainen ja arvoituksellinen ikääntymätön organismi elävät omituisessa symbioosissa. On kuin heidät olisi aina tarkoitettu yhteen, ja heidän tapaamisensa iskee molempiin ilmestyksen lailla. Upstream Color on runollinen tieteissaaga, jonka on kirjoittanut ja ohjannut aikamatkustusmysteeri Primerilla läpimurtonsa tehnyt Shane Carruth.