Elokuva kertoo kahdesta 1600-luvulla eläneestä jesuiittapapista, jotka lähtevät uhkarohkealle matkalle Japaniin löytääkseen kadonneen oppi-isänsä. Heidän matkansa tarkoitus on myös levittää kristinuskon sanomaa, mutta tuon ajan Japanissa kristityt kohtaavat armotonta väkivaltaa ja vainoa, joten miesten ristiretkestä muodostuu hengenvaarallinen.