Da Flynn, verdens største spildesigner, sender et hemmeligt signal fra en skjult digital verden, opfanges det af hans søn, som bestemmer sig for at redde faderen der har været forsvundet i lang tid. Sammen med den frygtløse kvindelige kriger Quorra kæmper far og søn for at besejre ondskaben i et svimlende cyberunivers.