I det varme tropiske hav ved Great Barrier Reef bor en klovnfisk ved navn Marvin. I en beskyttet forsænkning lever han et trygt og stille liv med sin eneste søn Nemo. Da Nemo pludselig bliver fanget og ført langt væk hjemmefra, til et akvarium hos en tandlæge, bliver Marvin nødt til at tage ud i det ukendte for at redde sin søn.